La Page de Jean-Paul Armspach

Jean-Paul ARMSPACH

Ingénieur de recherche
Responsable de l'équipe de recherche en Traitement d'Images Médicales (TIM)

Université Louis Pasteur
Faculté de Médecine
Institut Physique Biologique
4, rue Kirschleger
F-67085 Strasbourg Cedex (FRANCE)
Téléphone : (+33) (0) 390 244 041
Télécopie : (+33) (0) 390 244 084
Adresse électronique : armspach@ipb.u-strasbg.fr
Web : http://www-ipb.u-strasbg.fr/staff/armspach/armspach.html

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Enseignement

Ouvrage

Administratif

Recherche

Travaux en cours :

Détection de changements dans des séquences d'images médicales 3D multi-modales ; De la texture à la structure. (thèse en cours 2004 : M. Brucher co-encadrement avec F. Heitz , LSIIT et C. Heinrich , LSIIT ).
Détection de changements dans des séquences temporelles d'images médicales 3D multimodales : Application à la SEP (thèse en cours 2005 : M. Tobie co-encadrement avec F. Heitz , LSIIT ).
Segmentation d'images IRM anatomiques multimodales couplant inférence bayésienne et modèles a priori de haut niveau. (thèse en cours 2005 : S. Bricq co-encadrement avec C. Collet , LSIIT ).

Travaux réalisés :

Atlas statistique anatomique du cerveau humain. Application au recalage, à la segmentation et à l'aide au diagnostic. (thèse : Vincent NOBLET , soutenue en Mars 2006).
Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l'analyse de séquences d'images IRM fonctionnelles cérébrales (thèse : S. Faisan , soutenue en Décembre 2004).
Modèles statistiques d'apparence 3D. Application à la création d'un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l'aide au diagnostic. (thèse : T. Vik , soutenue Septembre 2004).
Détection de changements dans des séquences d'images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions du cerveau en sclérose en plaques. (thèse : M. Bosc , soutenue en Décembre 2003).

Construction d'un atlas anatomique numérique probabiliste du cerveau humain

O. Musse

Recalage d'images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables sous contraintes statistiques (thèse : C. Nikou , soutenue en Juin 1999).

Mots Clés

Traitement d'imagerie médicale mutimodale, recalage rigide et non-rigide, segmentation basé sur des modèles avec a priori de haut niveau, atlas anatomique et fonctionnel du cerveau humain, détection statistique de changements dans des séquences d'images temporelles, comparaison de population.

Publications (récentes) :

Nicolas Passat, Christian Ronse, Joseph Baruthio, Jean Paul Armspach, Claude Maillot, Christine Jahn. Region-growing segmentation of brain vessels: An atlas-based automatic approach. Journal of Magnetic Resonance Imaging pages 715-725 (2005)
Sylvain Faisan, Laurent Thoraval, Jean Paul Armspach, Jack Foucher, Marie-Noélle Metz-Lutz, Fabrice Heitz. Hidden Markov Event Sequence Models Towards Unsupervised Functional MRI Brain Mapping. Academic Radiology Vol. 12 pages 25-36 - (2005)
Sylvain Faisan, Laurent Thoraval, Jean Paul Armspach, Marie-Noélle Metz-Lutz, Fabrice Heitz. Unsupervised Learning and Mapping of Active Brain Functional MRI Signals Based on Hidden Semi-Markov Event Sequence Models. IEEE Transaction on Medical Imaging Vol. 24 pages 263-276 - (2005)
Torbjörn Vik, Fabrice Heitz, Izzie Jacques Namer, Jean Paul Armspach. On the Modeling, construction and evaluation of a probabilistic Atlas of Brain Perfusion. NeuroImage Vol. 24 pages 1088-1098 - (2005)
Vincent Noblet, Christian Heinrich, Fabrice Heitz, Jean Paul Armspach. 3-D deformable image registration: a topology preservation scheme based on hierarchical multiscale deformation models and interval analysis optimization. IEEE Transactions on Image Processing Vol. 14 pages 553-566 - (2005)
Michel Salomon, Fabrice Heitz, Guy-René Perrin, Jean Paul Armspach. A massively parallel approach to deformable matching of 3D medical images via stochastic differential equations. Parallel Computing Vol. 31 pages 45-71 - (2005)
M. Bosc, F. Heitz, J.P. Armspach, IJ Namer, D. Gounot, L. Rumbach. Automatic Change Detection in Multi-Modal Serial MRI: Application to Multiple Sclerosis Lesion Evolution. NeuroImage 20(2), 643-656 (2003).
O. Nikou, F. Heitz, A Nehlig, IJ Namer, JP Armspach. A robust statistics-based global energy function for the alignment of serially acquired autoradiographic sections. J. Neurosci. Methods 124(1), 93 - 102 (2003)
O. Musse, F. Heitz, JP Armspach. Fast Deformable Matching of 3D Images over Multiscale Nested Subspaces. Application to Atlas-Based MRI Segmentation. Pattern recognition Vol 36/8 1881-1899 (2003)
M.P. Valenti, S. Froelich, J.P. Armspach, M.P. Chenard, J.L. Dietemann, P. Kerhli, C. Marescaux, E. Hirsch, I.J. Namer Contribution of SISCOM imaging in the presurgical evaluation of temporal lobe epilepsy related to dysembryoplastic neuroepithelial tumors. Epilepsia 43(3), 270-276 (2002).
A Thiriaux A De Saint-Martin, L Vercueil, F Battaglia, JP Armspach, E HIirsch, C Marescaux, IJ Namer. Co-occurrence of infantile partial seizures and childhood paroxysmal choreoathetosis in one family: clinical, EEG and SPECT characterization of episodic events. Movement Disorders 17(1):98-104, (2002).
O. Musse, F. Heitz, J.P. Armspach. Topolgy preserving deformable image matching using constrained hierarchical parametric models. IEEE Transactions on Image Processing Vol 10 No 7 pp 1081-1093 (2001).
G. Bueno, O Musse, F. Heitz, J.P. Armspach. 3D segmentations of anatomical structures in MR images on large data bases. Magn. Res. Imag. Vol 19/1, pp. 73-88 (2001).
M Stevanov, J Baruthio, O Muusse, D. Gounot, JP Armspach. Determination of vessel cross section for flow rate quantification. Magn. Res. Imag. Vol 9:6 pp. 891-897, (2001).
C. Nikou, G. Bueno, O. Musse, F. Heitz, J.P. Armspach. A joint physics-based statistical deformable model for multimodal brain image analysis. IEEE Transaction on Medical Imaging Vol 20 No 10 pp 1026-1037 (2001)
M.N. Metz-lutz, I.J. Namer, D. Gounot, C. Kleitz, J.P. Armspach, P. Kehrli. Language functional neuro-imaging changes following focal left thalamic infarction. NeuroReport vol 11, N°13, pp 2907-2912 (2000).
C. Nikou, F. Heitz, J.P. Armspach, IJ Namer. Mesures de similarité robustes pour le recalage d'images médicales volumiques multimodales. Traitement du signal. vol. 16, No 3, pp. 255-272 (1999)..
C. Nikou, F. Heitz et J.P. Armspach. Robust voxel similarity metrics for the registration of dissimilar single and multimodal images, Pattern Recognition, Vol. 32, No 8, pp. 1349-1366 (1999).
O. Musse, J.-P. Armspach, I. J. Namer, F. Heitz, F. Hennel, D. Grucker. Data-driven curvilinear reconstructions of 3D MR images, Magnetic Resonance Imaging, Vol. 16, No 7, pp. 1227-1235 (1998).
I.J. Namer, R. Waydelich, J.P. Armspach, E. Hirsch, C. Marescaux, D. Grucker. Contribution of T2 relaxation time mapping in the evaluation of cryptogenic temporal lobe epilepsy. NeuroImage 7 :304-313 (1998).
C. Nikou, F. Heitz, J.P. Armspach, I.J. Namer, D. Grucker. Registration of MR/MR and MR/SPECT brain images by fast stochastic optimization of robust voxel similarity measures, Neuroimage, Vol. 8, No 6, pp. 30-43 (1998).

Liste complète des publications

Enseignement

Unix utilisation : Cours 2 Année ENSPS.
Traitement d'images Médicales : Master Recherche ISPI, école d'ingénieur ISIFC.
Application de l'informatique à l'imagerie médicale. (1ère année, 3ème cycle étude odontologique).
Cours sur l'utilisation du système d'exploitation Unix et Windows : formation permanente ULP, CNRS, DEPULP.

Ouvrages

Le système d'exploitation Unix : Initiation et utilisation. InterEditions 1994 (ISBN: 2-7296-0479-0).
Unix : Initiation et utilisation. Cours et exercices corrigés. Dunod 2005 (3ième édition). (ISBN: 2-10-007654-X)
Linux : Initiation et utilisation. Cours et exercices corrigés. Dunod 2004 (2ième édition). (ISBN: 2-10-048491-5)

Administratif

Membre du comité de pilotage de IRMC.
Membre du Conseil d'Orientation Réseau - Informatique - Multimédia (CORIM) de l'ULP.
Ancien membre élu de la commission paritaire d'établissement (CPE) de l'ULP.
Membre du groupe sécurité du groupe X/Stra .