Jean-Paul ARMSPACH Ingénieur de recherche Responsable de l'équipe de recherche en Imagerie in vivo du LINC Directeur de la plate-forme d'imagerie in vivo de Strasbourg - Campus médecine

Université de Strasbourg Faculté de Médecine Institut Physique Biologique 4, rue Kirschleger F-67085 Strasbourg Cedex (FRANCE) Téléphone : (+33) (0) 368 854 041 Télécopie : (+33) (0) 368 854 084 Adresse électronique : jeanpaul.armspach@unistra.fr Web : http://www-ipb.u-strasbg.fr/ipb/tim/staff/armspach/armspach.html

Thématiques de recherche :

• Traitement d'images médicales
• Segmentation d'images 3D multimodales.
• Detection statistiques de changement en imagerie multi-modales 3D+t.

Travaux en cours :

• Détection de changements dans des séquences temporelles d'images médicales 3D multimodales : Application à la SEP (thèse en cours depuis 2005 : S. Sharma co-encadrement avec F. Heitz , LSIIT et F. Rousseau, LSIIT ).
• Détection de changements en IRM de diffusion et du tenseur de diffusion. Application à la détection aux pathologies cérébrales. (thèse en cours depuis 2009 : A. Grigis co-encadrement avec F. Heitz , LSIIT et V. Noblet , LSIIT ).
• Création et utilisation d'atlas de spectres RMN HRMAS-2D pour la comparaison et la classification de tissus. Application à l'étude des tissus des modèles animaux de la sclérose En Plaques (SEP). (thèse en cours depuis 2009 : A. Grigis co-encadrement avec C. Collet , LSIIT )
• Etude en tractographie de diffusion de la maturation de la substance blanche lors de la croissance. (thèse en cours depuis 2006 : M. Koob co-encadrement avec JL. Dietemann , LINC )

Encadrement de 9 thèses soutenues : :

• Detection automatique de changements en IRM de diffusion : Application à l'étude longitudinale en sclérose en plaques. (thèse soutenue en Juillet 2010 : H. Boisgontier co-encadrement avec F. Heitz , LSIIT et V. Noblet , LSIIT ).
• Segmentation d'images IRM anatomiques multimodales couplant inférence bayésienne et modèles a priori de haut niveau. (thèse soutenue en novembre 2008 : S. Bricq co-encadrement avec C. Collet , LSIIT ).
• Présentations compactes et apprentissage non supervisé de variétés non linéaires. Application au traitement d'images. (thèse soutenue en Octobre 2008 : M. Brucher co-encadrement avec F. Heitz , LSIIT et C. Heinrich , LSIIT ).
• Atlas statistique anatomique du cerveau humain. Application au recalage, à la segmentation et à l'aide au diagnostic. (thèse : Vincent NOBLET , soutenue en Mars 2006).
• Analyse et fusion markovienne de séquences en imagerie 3D+t. Application à l'analyse de séquences d'images IRM fonctionnelles cérébrales (thèse : S. Faisan , soutenue en Décembre 2004).
• Modèles statistiques d'apparence 3D. Application à la création d'un atlas probabiliste de perfusion cérébrale pour l'aide au diagnostic. (thèse : T. Vik , soutenue Septembre 2004).
• Détection de changements dans des séquences d'images médicales 3D multimodales. Application à la détection et au suivi des lésions du cerveau en sclérose en plaques. (thèse : M. Bosc , soutenue en Décembre 2003).
• Construction d'un atlas anatomique numérique probabiliste du cerveau humain en vue d'automatiser la localisation et l'étiquetage de régions anatomiques (thèse : O. Musse , soutenue en Décembre 2000).
• Recalage d'images médicales multimodales : approches par fonctions de similarité robustes et modèles déformables sous contraintes statistiques (thèse : C. Nikou , soutenue en Juin 1999).

Mots Clés

Traitement d'images médicales mutimodales, recalage rigide et non-rigide, segmentation basée sur des modèles avec a priori de haut niveau, atlas anatomique et fonctionnel du cerveau humain, détection statistique de changements dans des séquences d'images temporelles multi-modales (IRM, DTI, ASL; ...), classification.

Publications :

Liste des publications dans les journaux
Liste complète des publications (version Basilic)
Liste complète des publications

• Unix utilisation : Cours 2 Année ENSPS.
• Architecture des ordinateurs : Cours 2 Année ENSPS.
• Traitement d'images Médicales : Master Recherche IRIV.
• Cours sur l'utilisation du système d'exploitation Unix et Windows : formation permanente ULP, CNRS, DEPULP.
Architecture des ordinateurs : Cours deuxième année école d'ingénieur ENSPS.
• Traitement d'images Médicales : Master Recherche ISTI.

• Le système d'exploitation Unix : Initiation et utilisation. InterEditions 1994 (ISBN: 2-7296-0479-0).
• Unix : Initiation et utilisation. Cours et exercices corrigés. Dunod 2005 (3ième édition). (ISBN: 2-10-007654-X)
• Linux : Initiation et utilisation. Cours et exercices corrigés. Dunod 2004 (2ième édition). (ISBN: 2-10-048491-5)

• Responsable de l'équipe de recherche Imagerie in vivo du LINC.
• Directeur de la plate-forme d'imagerie in vivo de strasbourg - campus médecine.
• Membre du comité de pilotage de IRMC.
• Membre du comité de pilotage de ICube.
• Membre élu de la commission paritaire d'établissement (CPE) de l'UdS.
• Ancien membre élu de la commission administrative paritaire nationale (CAPN).
• Membre du groupe X/Stra .